MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 38217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012883	TGTAT	2	10	21	30	20 %	60 %	20 %	0 %	242397998
2	NC_012883	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
3	NC_012883	T	8	8	134	141	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
4	NC_012883	CTTT	2	8	145	152	0 %	75 %	0 %	25 %	242397998
5	NC_012883	CCTCT	2	10	235	244	0 %	40 %	0 %	60 %	242397998
6	NC_012883	TTC	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242397998
7	NC_012883	CAG	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242397998
8	NC_012883	CCA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242397998
9	NC_012883	AGA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242397998
10	NC_012883	GCAG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	242397998
11	NC_012883	A	6	6	445	450	100 %	0 %	0 %	0 %	242397998
12	NC_012883	T	7	7	472	478	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
13	NC_012883	AGAT	2	8	482	489	50 %	25 %	25 %	0 %	242397998
14	NC_012883	TAA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242397998
15	NC_012883	ACTC	2	8	577	584	25 %	25 %	0 %	50 %	242397998
16	NC_012883	TCCA	2	8	778	785	25 %	25 %	0 %	50 %	242397998
17	NC_012883	CCA	3	9	839	847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242397998
18	NC_012883	ATTTT	2	10	866	875	20 %	80 %	0 %	0 %	242397998
19	NC_012883	ATA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242397998
20	NC_012883	CAA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242397998
21	NC_012883	TA	3	6	1062	1067	50 %	50 %	0 %	0 %	242397998
22	NC_012883	C	6	6	1130	1135	0 %	0 %	0 %	100 %	242397998
23	NC_012883	AT	3	6	1151	1156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012883	TA	3	6	1161	1166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012883	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012883	CGGT	2	8	1351	1358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012883	T	6	6	1372	1377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012883	TCT	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012883	AGG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012883	TTTC	2	8	1713	1720	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012883	G	6	6	1760	1765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012883	CAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012883	CTTT	2	8	1811	1818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012883	T	6	6	1816	1821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012883	C	6	6	1941	1946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_012883	ATT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012883	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012883	TCA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012883	C	6	6	2235	2240	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_012883	TCC	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012883	GTA	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012883	GGAG	2	8	2419	2426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012883	AGAT	2	8	2534	2541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012883	A	6	6	2556	2561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012883	TCT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012883	TTA	2	6	2669	2674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012883	CT	3	6	2750	2755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012883	TA	3	6	2784	2789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012883	TCA	2	6	2897	2902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012883	A	6	6	2905	2910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012883	TAA	2	6	2937	2942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012883	T	6	6	2952	2957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012883	TCCTC	2	10	3055	3064	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_012883	CT	3	6	3099	3104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012883	TTTCT	2	10	3170	3179	0 %	80 %	0 %	20 %	242397999
56	NC_012883	TCT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242397999
57	NC_012883	AGG	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242397999
58	NC_012883	GCATA	2	10	3395	3404	40 %	20 %	20 %	20 %	242397999
59	NC_012883	CT	3	6	3412	3417	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
60	NC_012883	AGA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242397999
61	NC_012883	CT	3	6	3546	3551	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
62	NC_012883	TC	3	6	3594	3599	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
63	NC_012883	TCTTT	2	10	3675	3684	0 %	80 %	0 %	20 %	242398000
64	NC_012883	AGA	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398000
65	NC_012883	T	6	6	3773	3778	0 %	100 %	0 %	0 %	242398000
66	NC_012883	A	6	6	3818	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	242398000
67	NC_012883	CCG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012883	AAG	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398001
69	NC_012883	CTC	2	6	3991	3996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398001
70	NC_012883	TCCAG	2	10	4005	4014	20 %	20 %	20 %	40 %	242398001
71	NC_012883	T	6	6	4027	4032	0 %	100 %	0 %	0 %	242398001
72	NC_012883	TA	3	6	4210	4215	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
73	NC_012883	AT	3	6	4234	4239	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
74	NC_012883	CTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398001
75	NC_012883	TCC	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398001
76	NC_012883	CAGA	2	8	4422	4429	50 %	0 %	25 %	25 %	242398001
77	NC_012883	TCA	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398001
78	NC_012883	TAAT	2	8	4566	4573	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
79	NC_012883	AGCC	2	8	4610	4617	25 %	0 %	25 %	50 %	242398001
80	NC_012883	AAC	2	6	4648	4653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398001
81	NC_012883	C	6	6	4659	4664	0 %	0 %	0 %	100 %	242398001
82	NC_012883	CCA	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398001
83	NC_012883	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398001
84	NC_012883	CAA	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
85	NC_012883	GAT	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
86	NC_012883	TAAA	2	8	5005	5012	75 %	25 %	0 %	0 %	242398002
87	NC_012883	GTA	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
88	NC_012883	CAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
89	NC_012883	CCT	2	6	5110	5115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398002
90	NC_012883	TTC	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398002
91	NC_012883	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398002
92	NC_012883	AGT	2	6	5274	5279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
93	NC_012883	AGG	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398002
94	NC_012883	ACA	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
95	NC_012883	AAC	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
96	NC_012883	CGT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398002
97	NC_012883	ACG	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398002
98	NC_012883	CTT	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398002
99	NC_012883	CGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398002
100	NC_012883	CTC	2	6	5740	5745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398002
101	NC_012883	TAA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012883	CCT	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
103	NC_012883	TCC	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
104	NC_012883	GGA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398003
105	NC_012883	TTCTCC	2	12	6061	6072	0 %	50 %	0 %	50 %	242398003
106	NC_012883	TGA	2	6	6155	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398003
107	NC_012883	AGGT	2	8	6235	6242	25 %	25 %	50 %	0 %	242398003
108	NC_012883	TAT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398003
109	NC_012883	C	6	6	6383	6388	0 %	0 %	0 %	100 %	242398003
110	NC_012883	TGT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398003
111	NC_012883	ATA	2	6	6513	6518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398003
112	NC_012883	AAC	3	9	6522	6530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398003
113	NC_012883	GTA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398003
114	NC_012883	CTT	3	9	6625	6633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
115	NC_012883	ATA	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398003
116	NC_012883	CCA	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398003
117	NC_012883	CGT	2	6	6680	6685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398003
118	NC_012883	TC	3	6	6698	6703	0 %	50 %	0 %	50 %	242398003
119	NC_012883	C	6	6	6777	6782	0 %	0 %	0 %	100 %	242398003
120	NC_012883	GAA	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
121	NC_012883	CAG	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398003
122	NC_012883	TTC	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
123	NC_012883	GAA	2	6	7017	7022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
124	NC_012883	GGGTT	2	10	7080	7089	0 %	40 %	60 %	0 %	242398003
125	NC_012883	CCG	2	6	7396	7401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398003
126	NC_012883	CAAG	2	8	7457	7464	50 %	0 %	25 %	25 %	242398003
127	NC_012883	GCAA	2	8	7516	7523	50 %	0 %	25 %	25 %	242398003
128	NC_012883	AGA	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
129	NC_012883	TAAA	2	8	7590	7597	75 %	25 %	0 %	0 %	242398003
130	NC_012883	AGA	2	6	7673	7678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
131	NC_012883	A	6	6	7758	7763	100 %	0 %	0 %	0 %	242398003
132	NC_012883	CTT	2	6	7767	7772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
133	NC_012883	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
134	NC_012883	TTAT	2	8	7933	7940	25 %	75 %	0 %	0 %	242398003
135	NC_012883	CCT	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
136	NC_012883	CCT	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
137	NC_012883	CATCC	2	10	8142	8151	20 %	20 %	0 %	60 %	242398003
138	NC_012883	TTC	2	6	8169	8174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012883	ATCT	2	8	8204	8211	25 %	50 %	0 %	25 %	242398004
140	NC_012883	CT	3	6	8223	8228	0 %	50 %	0 %	50 %	242398004
141	NC_012883	CT	3	6	8233	8238	0 %	50 %	0 %	50 %	242398004
142	NC_012883	ACA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398004
143	NC_012883	ACA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398004
144	NC_012883	TCA	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398004
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151	NC_012883	AACCA	2	10	8629	8638	60 %	0 %	0 %	40 %	242398004
152	NC_012883	T	6	6	8648	8653	0 %	100 %	0 %	0 %	242398004
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163	NC_012883	TCCC	2	8	9092	9099	0 %	25 %	0 %	75 %	242398005
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259	NC_012883	TGA	2	6	13147	13152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398008
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261	NC_012883	TC	3	6	13204	13209	0 %	50 %	0 %	50 %	242398008
262	NC_012883	TCC	2	6	13247	13252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398008
263	NC_012883	GATA	2	8	13320	13327	50 %	25 %	25 %	0 %	242398008
264	NC_012883	TGG	2	6	13409	13414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398008
265	NC_012883	ATA	2	6	13422	13427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398008
266	NC_012883	CAG	2	6	13473	13478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398008
267	NC_012883	CCT	2	6	13512	13517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398008
268	NC_012883	ATG	2	6	13595	13600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398008
269	NC_012883	ATC	2	6	13648	13653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398008
270	NC_012883	TTA	2	6	13704	13709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398008
271	NC_012883	GTG	2	6	13786	13791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012883	GCA	2	6	13836	13841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398009
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402	NC_012883	TTA	2	6	20863	20868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398016
403	NC_012883	TAGCTG	2	12	20913	20924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	242398016
404	NC_012883	AG	3	6	20977	20982	50 %	0 %	50 %	0 %	242398016
405	NC_012883	GATT	2	8	20983	20990	25 %	50 %	25 %	0 %	242398016
406	NC_012883	GAC	2	6	21016	21021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398016
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